La Commission dispose des pouvoirs d'investigation les plus étendus:
- Libre accès aux sources d'information;
- Recours à l'expertise;
- Réquisition de la police;
- Obligation de comparution des personnes convoquées;
- Saisir le Ministère public contre les auteurs d'entraves à l'exécution des missions de la Commission;
- Saisine des instances judiciaires en cas de contestation ou d'inexécution de ses avis et recommandations